Descendiente de los reyes de Navarra, España, nació en Pamplona, en el castillo de Javier, el año 1506.
Siendo un brillante profesor de filosofía en la Universidad de París conoció a San Ignacio de Loyola que lo convirtió en uno de los primeros miembros de la Compañía de Jesús, recientemente fundada.
Enviado a la India, descubierta por los portugueses, y designado por Paulo III nuncio apostólico en aquel país, llegó a Goa en 1542; recorrió innumerables provincias, e introdujo la fe cristiana en la India Oriental, en el Japón y en Oceanía.
En 10 años evangelizó más de 50 reinos, bautizó a reyes y príncipes y a muchos miles de hombres.
Murió a los 46 años de edad en la desierta isla de Sanclán, el 3 de diciembre de 1552, a la vista de China, cuya conquista espiritual se disponía a emprender. Su cuerpo se conserva en la ciudad de Goa (India).
Pío XI lo declaró patrono de la propagación de la fe de las misiones católicas.